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Application de la microfluidique de gouttes à la conception d'un appareil de PCR en flux continu. / Chabert, Max in La Houille blanche, N° 5 (2006) 

Public ISBD [article]  in La Houille blanche > N° 5 (2006) . - 51-56 p. Titre : Application de la microfluidique de gouttes à la conception d'un appareil de PCR en flux continu. Titre original : Using droplet microfluidics to design a continuous flow PCR system. Type de document : texte imprimé Auteurs : Chabert, Max, Auteur ; Dorfman, Kevin D., Auteur ; Viovy, Jean-Louis, Auteur Article en page(s) : 51-56 p. Note générale : Hydraulique Langues : Français (fre) Mots-clés : Microfluidique  Flux  continu  Ecoulement  biphasique  Gouttes  Capillaire Index. décimale : 551.4 Résumé : The design of a two-phase-flow (water in oil) microfluidic PCR system led us to solve different problems in order to achieve DNA amplification : droplet train instability, cross contamination between droplets, being able to coalesce two droplets without direct contact with them. After a short explanation of the PCR principle, the experimental conditions used to achieve droplets train stability and avoid contamination between droplets will be presented, as well as the amplification results obtained. We will then present a system based on the electrocoalescence principle which allows to coalesce without direct contact two water droplets inside the capillary. La réalisation d’un système de PCR (polymerase chain reaction) microfluidique fonctionnant en mode biphasique solution aqueuse/huile pour effectuer des réactions d’amplification d’ADN nous a confrontés à divers problèmes: la réalisation du mélange entre deux gouttes se suivant dans le capillaire, la stabilité des trains de gouttes et la contamination croisée entre gouttes. Après une rapide explication du principe de la PCR, nous décrirons les conditions expérimentales utilisées afin de réduire les instabilités de train de gouttes et la contamination inter-gouttes puis les résultats de PCR obtenus avec l’appareil microfluidique mis au point au laboratoire. Un système basé sur le principe de l’électrocoalescence utilisé afin de réaliser sans contact direct le mélange entre deux gouttes successives dans le capillaire sera ensuite présenté. DEWEY : 553.7 ISSN : 0018-6368 RAMEAU : Microfluidique En ligne : http://www.shf-lhb.org/index.php?option=article&access=standard&Itemid=129&url=/ [...] [article] Application de la microfluidique de gouttes à la conception d'un appareil de PCR en flux continu. = Using droplet microfluidics to design a continuous flow PCR system. [texte imprimé] / Chabert, Max, Auteur ; Dorfman, Kevin D., Auteur ; Viovy, Jean-Louis, Auteur . - 51-56 p. Hydraulique Langues : Français (fre) in La Houille blanche > N° 5 (2006) . - 51-56 p. Mots-clés : Microfluidique  Flux  continu  Ecoulement  biphasique  Gouttes  Capillaire Index. décimale : 551.4 Résumé : The design of a two-phase-flow (water in oil) microfluidic PCR system led us to solve different problems in order to achieve DNA amplification : droplet train instability, cross contamination between droplets, being able to coalesce two droplets without direct contact with them. After a short explanation of the PCR principle, the experimental conditions used to achieve droplets train stability and avoid contamination between droplets will be presented, as well as the amplification results obtained. We will then present a system based on the electrocoalescence principle which allows to coalesce without direct contact two water droplets inside the capillary. La réalisation d’un système de PCR (polymerase chain reaction) microfluidique fonctionnant en mode biphasique solution aqueuse/huile pour effectuer des réactions d’amplification d’ADN nous a confrontés à divers problèmes: la réalisation du mélange entre deux gouttes se suivant dans le capillaire, la stabilité des trains de gouttes et la contamination croisée entre gouttes. Après une rapide explication du principe de la PCR, nous décrirons les conditions expérimentales utilisées afin de réduire les instabilités de train de gouttes et la contamination inter-gouttes puis les résultats de PCR obtenus avec l’appareil microfluidique mis au point au laboratoire. Un système basé sur le principe de l’électrocoalescence utilisé afin de réaliser sans contact direct le mélange entre deux gouttes successives dans le capillaire sera ensuite présenté. DEWEY : 553.7 ISSN : 0018-6368 RAMEAU : Microfluidique En ligne : http://www.shf-lhb.org/index.php?option=article&access=standard&Itemid=129&url=/ [...]

Autoassemblage de colloïdes magnétiques sur un réseau de plots en nickel : application a l’électrophorèse de longs ADN / Saliba, Antoine-Emmanuel in La Houille blanche, N°6 (2007) 

Public ISBD [article]  in La Houille blanche > N°6 (2007) . - 34-38 p. Titre : Autoassemblage de colloïdes magnétiques sur un réseau de plots en nickel : application a l’électrophorèse de longs ADN Titre original : Magnetic beads self-organization on ni pattern: application to long dna electrophoresis Type de document : texte imprimé Auteurs : Saliba, Antoine-Emmanuel, Auteur ; Minc, Nicolas, Auteur ; Viovy, Jean-Louis, Auteur Article en page(s) : 34-38 p. Note générale : Hydraulique Langues : Français (fre) Mots-clés : Colloïdes  magnétiques  Longs  ADN  Electrophorèses  Réseaux  micro  lithographiés  Plots  de  nickel Index. décimale : 551.4 Résumé : When placed in a Hele-Shaw cell and submitted to a uniform magnetic field, a suspension of superparamagnetic particles self-organizes into a 2D array of columns with hexagonal order on short distances and glasslike order on long distances. Such arrays were usefully used for fast electrophoretic separation of long DNA molecules. Although self-assembled matrices have the advantages of simplicity and tunability, it is impossible to have the precisely controlled order and pore size obtainable in a microlithographic array. We address the latter challenge here. A magnetic nickel template is prepared on one cell surface by lift-off. Under a uniform external field, the nickel dots create local magnetic field gradients that attracts the beads, imposing a predefined order. We demonstrate the ability to separate long DNA molecules with these matrices and achieve the first steps of studying the resolution of the DNA separation over a wide range of posts density. Placée dans une cellule de Hele-Shaw et soumise à un champ magnétique extérieur, une suspension de billes superparamagnétiques s’autoorganise en un réseau 2D de colonnes avec un ordre hexagonal à courte distance et vitreux à longue distance. Ces réseaux ont été utilisés par le passé pour réaliser des électrophorèses de long ADN. Bien qu’ayant l’avantage de la simplicité de mise en œuvre, il n’est pas possible de contrôler l’organisation ni la taille des pores comme avec les réseaux microlithographiés. La présente étude répond à cette problématique. Un dépôt de nickel est réalisé sur une surface de la puce par lift-off. Sous un champ magnétique extérieur uniforme, les plots de nickel créent un champ magnétique local qui attire les billes imposant un ordre prédéfini. La séparation de longues molécules d’ADN est démontrée dans ces matrices et les premiers pas d’une étude de la résolution de la séparation d’ADN sur une large gamme de densité de réseau sont réalisés. DEWEY : 553.7 ISSN : 0018-6368 RAMEAU : Fluides magnétiques En ligne : http://www.shf-lhb.org/index.php?option=article&access=standard&Itemid=129&url=/ [...] [article] Autoassemblage de colloïdes magnétiques sur un réseau de plots en nickel : application a l’électrophorèse de longs ADN = Magnetic beads self-organization on ni pattern: application to long dna electrophoresis [texte imprimé] / Saliba, Antoine-Emmanuel, Auteur ; Minc, Nicolas, Auteur ; Viovy, Jean-Louis, Auteur . - 34-38 p. Hydraulique Langues : Français (fre) in La Houille blanche > N°6 (2007) . - 34-38 p. Mots-clés : Colloïdes  magnétiques  Longs  ADN  Electrophorèses  Réseaux  micro  lithographiés  Plots  de  nickel Index. décimale : 551.4 Résumé : When placed in a Hele-Shaw cell and submitted to a uniform magnetic field, a suspension of superparamagnetic particles self-organizes into a 2D array of columns with hexagonal order on short distances and glasslike order on long distances. Such arrays were usefully used for fast electrophoretic separation of long DNA molecules. Although self-assembled matrices have the advantages of simplicity and tunability, it is impossible to have the precisely controlled order and pore size obtainable in a microlithographic array. We address the latter challenge here. A magnetic nickel template is prepared on one cell surface by lift-off. Under a uniform external field, the nickel dots create local magnetic field gradients that attracts the beads, imposing a predefined order. We demonstrate the ability to separate long DNA molecules with these matrices and achieve the first steps of studying the resolution of the DNA separation over a wide range of posts density. Placée dans une cellule de Hele-Shaw et soumise à un champ magnétique extérieur, une suspension de billes superparamagnétiques s’autoorganise en un réseau 2D de colonnes avec un ordre hexagonal à courte distance et vitreux à longue distance. Ces réseaux ont été utilisés par le passé pour réaliser des électrophorèses de long ADN. Bien qu’ayant l’avantage de la simplicité de mise en œuvre, il n’est pas possible de contrôler l’organisation ni la taille des pores comme avec les réseaux microlithographiés. La présente étude répond à cette problématique. Un dépôt de nickel est réalisé sur une surface de la puce par lift-off. Sous un champ magnétique extérieur uniforme, les plots de nickel créent un champ magnétique local qui attire les billes imposant un ordre prédéfini. La séparation de longues molécules d’ADN est démontrée dans ces matrices et les premiers pas d’une étude de la résolution de la séparation d’ADN sur une large gamme de densité de réseau sont réalisés. DEWEY : 553.7 ISSN : 0018-6368 RAMEAU : Fluides magnétiques En ligne : http://www.shf-lhb.org/index.php?option=article&access=standard&Itemid=129&url=/ [...]

Microfluidic magnetic cell sorting system for cancer diagnosis / Laure Saias in La Houille blanche, N° 5 (2009) 

Public ISBD [article]  in La Houille blanche > N° 5 (2009) . - p. 105-111 Titre : Microfluidic magnetic cell sorting system for cancer diagnosis Titre original : Système microfluidique pour le tri et l'analyse de cellules dans le diagnostic du cancer Type de document : texte imprimé Auteurs : Laure Saias, Auteur ; Saliba, Antoine-Emmanuel, Auteur ; Viovy, Jean-Louis, Auteur Article en page(s) : p. 105-111 Note générale : Hydraulique 1er congrès européen de microfluidique Résumés en Français et Anglais Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Microfluidique  Cellules  --  Analyse  Cancer Index. décimale : 551.4 Résumé : This project is aimed at developing a new integrated microfluidic system for high throughput cell sorting and analysis. This micro-device will be able to sort rare population of cells, like circulating tumor cells (CTC) in whole blood, and analyze them by bright field and fluorescence microscopy at high magnification. Evaluating the concentration of CTC in blood will have a strong diagnosis and prognosis value, for evaluating risks of metastases and tumor cells dissemination. Cell sample flows through an array of magnetic columns that are coated with antibodies. These antibodies are specific of membrane protein that are expressed by the target cells and allow their capture in chip. Once they are trapped on columns, their shape and the expression of other proteins are observed by microscopy. As a proof of concept, Raji cells (B lymphocytes, CD19+) mixed with Jurkat cells (T lymphocytes, CD19-) with an initial concentration of 1/1000 are sorted in an array of magnetic beads functionalized with anti-CD19 antibodies. 500μL of sample are analyzed within 1 hour with a global capture yield of 55 +/- 10 %. The captured cells are then stained with immunofluorescent probes which provide membrane (anti- CD19-AlexaFluor 488) and nucleus (Hoechst) imaging. Imagining can be performed at high resolution microscopy, including 100X oil immersion objectives. Ce projet a pour objectif de développer un nouveau système microfluidique pour le tri et l'analyse de cellules à haut débit. Ce système pourra collecter des populations de cellules rares, comme des cellules tumorales circulantes (CTC) dans le sang, et les analyser en champ clair ainsi qu'en microscopie de fluorescence à haute résolution. L'évaluation de la concentration des CTC dans le sang, lié au risque de développement de métastases et de dissémination de cellules tumorales, aura un impact diagnostic et pronostic élevé. L'échantillon cellulaire s'écoule à travers un réseau de colonnes magnétiques couvertes d'anticorps. Ces anticorps sont spécifiques d'une protéine membranaire exprimée par les cellules cibles et permettent la capture de ces cellules dans la puce. Une fois les cellules immobilisées sur les colonnes, leur morphologie et l'expression d'autres protéines sont observées par microscopie. En temps que preuve de concept, des Raji ( lymphocytes B, CD19+) sont mélangées à des Jurkat( lymphocytes T, CD19-) à une concentration de 1/1000 et sont capturées dans le réseau de colonnes de billes magnétiques fonctionnalisées avec des anticorps anti-CD19. Un échantillon de 500μL est analysé en 1 heure avec un rendement global de 55 +/- 10 %. Les cellules capturées sont ensuite colorées avec des sondes immunofluorescentes afin d'imager leur membrane (anti-CD19-AlexaFluor 488) et leur noyau (Hoechst). Ces images peuvent être réalisées à haute résolution avec un grossissement de 100X. DEWEY : 553.7 ISSN : 0018-6368 RAMEAU : Microfluidique En ligne : http://www.shf-lhb.org/index.php?option=article&access=standard&Itemid=129&url=/ [...] [article] Microfluidic magnetic cell sorting system for cancer diagnosis = Système microfluidique pour le tri et l'analyse de cellules dans le diagnostic du cancer [texte imprimé] / Laure Saias, Auteur ; Saliba, Antoine-Emmanuel, Auteur ; Viovy, Jean-Louis, Auteur . - p. 105-111. Hydraulique 1er congrès européen de microfluidique Résumés en Français et Anglais Langues : Anglais (eng) in La Houille blanche > N° 5 (2009) . - p. 105-111 Mots-clés : Microfluidique  Cellules  --  Analyse  Cancer Index. décimale : 551.4 Résumé : This project is aimed at developing a new integrated microfluidic system for high throughput cell sorting and analysis. This micro-device will be able to sort rare population of cells, like circulating tumor cells (CTC) in whole blood, and analyze them by bright field and fluorescence microscopy at high magnification. Evaluating the concentration of CTC in blood will have a strong diagnosis and prognosis value, for evaluating risks of metastases and tumor cells dissemination. Cell sample flows through an array of magnetic columns that are coated with antibodies. These antibodies are specific of membrane protein that are expressed by the target cells and allow their capture in chip. Once they are trapped on columns, their shape and the expression of other proteins are observed by microscopy. As a proof of concept, Raji cells (B lymphocytes, CD19+) mixed with Jurkat cells (T lymphocytes, CD19-) with an initial concentration of 1/1000 are sorted in an array of magnetic beads functionalized with anti-CD19 antibodies. 500μL of sample are analyzed within 1 hour with a global capture yield of 55 +/- 10 %. The captured cells are then stained with immunofluorescent probes which provide membrane (anti- CD19-AlexaFluor 488) and nucleus (Hoechst) imaging. Imagining can be performed at high resolution microscopy, including 100X oil immersion objectives. Ce projet a pour objectif de développer un nouveau système microfluidique pour le tri et l'analyse de cellules à haut débit. Ce système pourra collecter des populations de cellules rares, comme des cellules tumorales circulantes (CTC) dans le sang, et les analyser en champ clair ainsi qu'en microscopie de fluorescence à haute résolution. L'évaluation de la concentration des CTC dans le sang, lié au risque de développement de métastases et de dissémination de cellules tumorales, aura un impact diagnostic et pronostic élevé. L'échantillon cellulaire s'écoule à travers un réseau de colonnes magnétiques couvertes d'anticorps. Ces anticorps sont spécifiques d'une protéine membranaire exprimée par les cellules cibles et permettent la capture de ces cellules dans la puce. Une fois les cellules immobilisées sur les colonnes, leur morphologie et l'expression d'autres protéines sont observées par microscopie. En temps que preuve de concept, des Raji ( lymphocytes B, CD19+) sont mélangées à des Jurkat( lymphocytes T, CD19-) à une concentration de 1/1000 et sont capturées dans le réseau de colonnes de billes magnétiques fonctionnalisées avec des anticorps anti-CD19. Un échantillon de 500μL est analysé en 1 heure avec un rendement global de 55 +/- 10 %. Les cellules capturées sont ensuite colorées avec des sondes immunofluorescentes afin d'imager leur membrane (anti-CD19-AlexaFluor 488) et leur noyau (Hoechst). Ces images peuvent être réalisées à haute résolution avec un grossissement de 100X. DEWEY : 553.7 ISSN : 0018-6368 RAMEAU : Microfluidique En ligne : http://www.shf-lhb.org/index.php?option=article&access=standard&Itemid=129&url=/ [...]