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Combination and comparison of chemometrics methods for identification of transgenic tomatoes using visible and near-infrared diffuse transmittance technique / Xie, Lijuan in Journal of food engineering, Vol. 82 N°3 (Octobre 2007) 

Public ISBD [article]  in Journal of food engineering > Vol. 82 N°3 (Octobre 2007) . - 395-401 p. Titre : Combination and comparison of chemometrics methods for identification of transgenic tomatoes using visible and near-infrared diffuse transmittance technique Type de document : texte imprimé Auteurs : Xie, Lijuan, Auteur ; Ying, Yibin, Auteur ; Ying, Tiejin, Auteur Article en page(s) : 395-401 p. Note générale : Génie Chimique Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Vis/NIR  spectroscopy  Transgenic  tomato  Identification  Chemometrics  Vis/NIR  spectroscopie  Tomates  transgéniques  Identification  Chemometrics Index. décimale : 664 Résumé : The potential of visible/near-infrared (Vis/NIR) diffuse transmittance spectroscopy, in combination with a variety of chemometrics techniques, was investigated to examine the feasibility to non-destructively distinguish transgenic tomatoes from non-transgenic tomatoes. One hundred tomatoes inserted with antisense ethylene receptor gene LeETR1 and the same number of their parents were scanned in the Vis/NIR regions. Principal component analysis (PCA), soft independent modelling of class analogy (SIMCA) and discriminant partial least squares (DPLS) regression based on PCA scores were applied to classify tomatoes with different genes into two groups. The results show that differences between transgenic and non-transgenic tomatoes do exist and excellent classification can be obtained after optimizing spectral pre-treatment. The correct classifications of the calibration as well as the validation data set for transgenic and non-transgenic tomatoes were 100% using DPLS after second derivative spectral pre-treatment. The results in the present study show that Vis/NIR spectroscopy together with chemometrics techniques could be a rapid tool to be used for differentiating transgenic tomatoes from conventional tomatoes. Le potentiel de visibles / proche infrarouge (Vis / NIR) diffuses spectroscopie de transmission, en combinaison avec une variété de techniques de chemometrics, une enquête a été d'étudier la possibilité de distinguer non destructive tomates transgéniques de tomates non transgéniques. Une centaine de tomates inséré avec antisens des récepteurs de l'éthylène gène LeETR1 et le même nombre de leurs parents ont été numérisés dans le Vis / NIR régions. Analyse en composantes principales (ACP), doux modélisation indépendante de la classe analogie (SIMCA) et discriminante moindres carrés partiels (DPLS) fondée sur la régression PCA scores ont été appliqués pour classer les tomates avec différents gènes en deux groupes. Les résultats montrent que les différences entre transgéniques et non transgéniques tomates existent et excellente classification peut être obtenue après optimisation spectrale de prétraitement. La classification correcte de l'étalonnage ainsi que l'ensemble des données pour la validation transgéniques et non transgéniques, les tomates étaient 100% en utilisant DPLS après dérivée seconde spectrale prétraitement. Les résultats de la présente étude montrent que Vis / NIR spectroscopie avec chemometrics techniques pourraient être un outil rapide à utiliser pour différencier les tomates transgéniques de tomates conventionnelles. DEWEY : 664 ISSN : 00260-8774 RAMEAU : Tomates En ligne : http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleListURL&_method=list&_ArticleLis [...] [article] Combination and comparison of chemometrics methods for identification of transgenic tomatoes using visible and near-infrared diffuse transmittance technique [texte imprimé] / Xie, Lijuan, Auteur ; Ying, Yibin, Auteur ; Ying, Tiejin, Auteur . - 395-401 p. Génie Chimique Langues : Anglais (eng) in Journal of food engineering > Vol. 82 N°3 (Octobre 2007) . - 395-401 p. Mots-clés : Vis/NIR  spectroscopy  Transgenic  tomato  Identification  Chemometrics  Vis/NIR  spectroscopie  Tomates  transgéniques  Identification  Chemometrics Index. décimale : 664 Résumé : The potential of visible/near-infrared (Vis/NIR) diffuse transmittance spectroscopy, in combination with a variety of chemometrics techniques, was investigated to examine the feasibility to non-destructively distinguish transgenic tomatoes from non-transgenic tomatoes. One hundred tomatoes inserted with antisense ethylene receptor gene LeETR1 and the same number of their parents were scanned in the Vis/NIR regions. Principal component analysis (PCA), soft independent modelling of class analogy (SIMCA) and discriminant partial least squares (DPLS) regression based on PCA scores were applied to classify tomatoes with different genes into two groups. The results show that differences between transgenic and non-transgenic tomatoes do exist and excellent classification can be obtained after optimizing spectral pre-treatment. The correct classifications of the calibration as well as the validation data set for transgenic and non-transgenic tomatoes were 100% using DPLS after second derivative spectral pre-treatment. The results in the present study show that Vis/NIR spectroscopy together with chemometrics techniques could be a rapid tool to be used for differentiating transgenic tomatoes from conventional tomatoes. Le potentiel de visibles / proche infrarouge (Vis / NIR) diffuses spectroscopie de transmission, en combinaison avec une variété de techniques de chemometrics, une enquête a été d'étudier la possibilité de distinguer non destructive tomates transgéniques de tomates non transgéniques. Une centaine de tomates inséré avec antisens des récepteurs de l'éthylène gène LeETR1 et le même nombre de leurs parents ont été numérisés dans le Vis / NIR régions. Analyse en composantes principales (ACP), doux modélisation indépendante de la classe analogie (SIMCA) et discriminante moindres carrés partiels (DPLS) fondée sur la régression PCA scores ont été appliqués pour classer les tomates avec différents gènes en deux groupes. Les résultats montrent que les différences entre transgéniques et non transgéniques tomates existent et excellente classification peut être obtenue après optimisation spectrale de prétraitement. La classification correcte de l'étalonnage ainsi que l'ensemble des données pour la validation transgéniques et non transgéniques, les tomates étaient 100% en utilisant DPLS après dérivée seconde spectrale prétraitement. Les résultats de la présente étude montrent que Vis / NIR spectroscopie avec chemometrics techniques pourraient être un outil rapide à utiliser pour différencier les tomates transgéniques de tomates conventionnelles. DEWEY : 664 ISSN : 00260-8774 RAMEAU : Tomates En ligne : http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleListURL&_method=list&_ArticleLis [...]

Comparison of diffuse reflectance and transmission mode of visible-near infrared spectroscopy for detecting brown heart of pear / Fu, Xiaping in Journal of food engineering, Vol. 83 N°3 (Decembre 2007) 

Public ISBD [article]  in Journal of food engineering > Vol. 83 N°3 (Decembre 2007) . - 317-323 p. Titre : Comparison of diffuse reflectance and transmission mode of visible-near infrared spectroscopy for detecting brown heart of pear Type de document : texte imprimé Auteurs : Fu, Xiaping, Auteur ; Ying, Yibin, Auteur ; Lu, Huishan, Auteur Article en page(s) : 317-323 p. Note générale : Génie Chimique Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Pear  Brown  heart  Spectroscopy  Diffuse  reflectance  Transmission  Discriminant  analysis  Poire  Brown  coeur  Spectroscopie  Réflexion  diffuse  Transmission  Analyse  discriminante Index. décimale : 664 Résumé : The objective of this research was to compare transmission and reflectance modes of visible (VIS)/near infrared (NIR) spectroscopy for detecting brown heart in pears. Transmission spectra were collected by a fiber spectrometer in the range of 400–1028 nm with two fruit-orientations: stem-calyx axis vertical (T1) and stem-calyx axis horizontal (T2). Diffuse reflectance spectra were acquired using a FT–NIR spectrometer with two detectors (Si: 670–1110 nm; InGaAs: 800–2630 nm). Discriminant analysis (DA) method was employed to classify the pears with brown heart and without brown heart. Better results were obtained based on transmission spectra than those on reflectance spectra. The classifying correctness was 91.2% by using transmission spectra acquired in fruit-orientation T2. Three defective pears and one sound pear were misclassified during calibration process and for validation, no defective pear was predicted incorrectly and only one sound pear was predicted as defect. The results indicate that VIS–NIR spectroscopy is feasible for detecting brown heart in pear and transmission mode is better than reflectance mode for internal disorder detection. L'objectif de cette recherche était de comparer les modes de transmission et de réflexion en lumière visible (VIS) / proche infrarouge (NIR) spectroscopie pour détecter cœur brun dans les poires. Transmission spectres ont été recueillies par un spectromètre à fibre optique dans la gamme des 400-1028 nm avec deux fruits orientations suivantes: - calice axe de la tige verticale (T1) et de souches calice axe horizontal (T2). Spectres de réflexion diffuse ont été acquises au moyen d'un spectromètre NIR FT - avec deux détecteurs (Si: 670-1110 mn; InGaAs: 800-2630 mn). Analyse discriminante (DA) méthode a été employée pour classer les poires avec le cœur brun et brun sans cœur. De meilleurs résultats ont été obtenus fondée sur la transmission des spectres que ceux sur les spectres de réflectance. L'exactitude du classement a été 91,2% à l'aide de la transmission des spectres acquis dans le secteur des fruits orientation T2. Trois défectueux poires et une saine poire étaient mal lors de l'étalonnage et de validation, aucune défaillance du poirier était prévue à tort et une seule poire sonore était prévue comme défaut. Les résultats indiquent que la spectroscopie VIS - NIR est possible de détecter dans le cœur brun poire et le mode de transmission est meilleure que la réflectance mode pour la détection des troubles internes. DEWEY : 664 ISSN : 0260-8774 RAMEAU : Poires En ligne : http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleListURL&_method=list&_ArticleLis [...] [article] Comparison of diffuse reflectance and transmission mode of visible-near infrared spectroscopy for detecting brown heart of pear [texte imprimé] / Fu, Xiaping, Auteur ; Ying, Yibin, Auteur ; Lu, Huishan, Auteur . - 317-323 p. Génie Chimique Langues : Anglais (eng) in Journal of food engineering > Vol. 83 N°3 (Decembre 2007) . - 317-323 p. Mots-clés : Pear  Brown  heart  Spectroscopy  Diffuse  reflectance  Transmission  Discriminant  analysis  Poire  Brown  coeur  Spectroscopie  Réflexion  diffuse  Transmission  Analyse  discriminante Index. décimale : 664 Résumé : The objective of this research was to compare transmission and reflectance modes of visible (VIS)/near infrared (NIR) spectroscopy for detecting brown heart in pears. Transmission spectra were collected by a fiber spectrometer in the range of 400–1028 nm with two fruit-orientations: stem-calyx axis vertical (T1) and stem-calyx axis horizontal (T2). Diffuse reflectance spectra were acquired using a FT–NIR spectrometer with two detectors (Si: 670–1110 nm; InGaAs: 800–2630 nm). Discriminant analysis (DA) method was employed to classify the pears with brown heart and without brown heart. Better results were obtained based on transmission spectra than those on reflectance spectra. The classifying correctness was 91.2% by using transmission spectra acquired in fruit-orientation T2. Three defective pears and one sound pear were misclassified during calibration process and for validation, no defective pear was predicted incorrectly and only one sound pear was predicted as defect. The results indicate that VIS–NIR spectroscopy is feasible for detecting brown heart in pear and transmission mode is better than reflectance mode for internal disorder detection. L'objectif de cette recherche était de comparer les modes de transmission et de réflexion en lumière visible (VIS) / proche infrarouge (NIR) spectroscopie pour détecter cœur brun dans les poires. Transmission spectres ont été recueillies par un spectromètre à fibre optique dans la gamme des 400-1028 nm avec deux fruits orientations suivantes: - calice axe de la tige verticale (T1) et de souches calice axe horizontal (T2). Spectres de réflexion diffuse ont été acquises au moyen d'un spectromètre NIR FT - avec deux détecteurs (Si: 670-1110 mn; InGaAs: 800-2630 mn). Analyse discriminante (DA) méthode a été employée pour classer les poires avec le cœur brun et brun sans cœur. De meilleurs résultats ont été obtenus fondée sur la transmission des spectres que ceux sur les spectres de réflectance. L'exactitude du classement a été 91,2% à l'aide de la transmission des spectres acquis dans le secteur des fruits orientation T2. Trois défectueux poires et une saine poire étaient mal lors de l'étalonnage et de validation, aucune défaillance du poirier était prévue à tort et une seule poire sonore était prévue comme défaut. Les résultats indiquent que la spectroscopie VIS - NIR est possible de détecter dans le cœur brun poire et le mode de transmission est meilleure que la réflectance mode pour la détection des troubles internes. DEWEY : 664 ISSN : 0260-8774 RAMEAU : Poires En ligne : http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleListURL&_method=list&_ArticleLis [...]

Nondestructive measurement of internal quality in pear using genetic algorithms and FT-NIR spectroscopy / Ying, Yibin in Journal of food engineering, Vol. 84 N°2 (Janvier 2008) 

Public ISBD [article]  in Journal of food engineering > Vol. 84 N°2 (Janvier 2008) . - 206-213 p. Titre : Nondestructive measurement of internal quality in pear using genetic algorithms and FT-NIR spectroscopy Type de document : texte imprimé Auteurs : Ying, Yibin, Auteur ; Liu, Yande, Auteur Article en page(s) : 206-213 p. Note générale : Génie Chimique Langues : Anglais (eng) Mots-clés : Genetic  algorithms  FT-NIR  spectroscopy  Nondestructive  measurement  Internal  quality  Wavelength  selection  Partial  least  squares  Algorithmes  génétiques  Spectroscopie  de  FT-NIR  Mesure  non  destructive  Qualité  interne  Choix  de  longueur  d'onde  Carrés  partiel Index. décimale : 664 Résumé : An improved genetic algorithms (GAs) is used to implement an automated wavelength selection procedure for use in building multivariate calibration models based on partial least squares regression. The methods also allow the number of latent variables used in constructing the calibration models to be optimized along with the selection of the wavelengths. Studies are performed to characterize the signal and noise characteristics of the spectral data, and optimal configurations for the GAs are found for each data set through experimental design techniques. The experiments tested in this method were sugar content (SC), titratable acidity (TA) and valid acidity (pH). Despite the complexity of the spectral data, the GAs procedure were found to perform well (RMSEP = 0.395, 0.0195, 0.0087 for SC, TA and pH respectively), leading to calibration models that significantly outperform those based on full-spectrum analyses (RMSEP = 0.512, 0.0198, 0.0111 for SC, TA and pH respectively). In addition, a significant reduction in the number of spectral points required to build the models is realized and all of the numbers of wavelengths for building the calibration models can reduce by 84.4%. This work proved that the GA could find optimal values for several disparate variables associated with the calibration model and that the PLS procedure could be integrated into the objective function driving the optimization. Des algorithmes génétiques améliorés (gaz) est employés pour mettre en application une procédure de sélection automatisée de longueur d'onde pour l'usage en établissant les modèles multivariables de calibrage basés sur la régression des moindres carrés partielle. Les méthodes permettent également le nombre de variables latentes utilisées en construisant les modèles de calibrage à optimiser avec le choix des longueurs d'onde. Des études sont réalisées pour caractériser les caractéristiques de signal et de bruit des données spectrales, et des configurations optimales pour le gaz sont trouvées pour chaque ensemble de données par des techniques de plan d'expérience. Les expériences ont examiné dans cette méthode étaient le contenu de sucre (Sc), l'acidité titrable (TA) et l'acidité valide (pH). En dépit de la complexité des données spectrales, le procédé de gaz se sont avérés pour se comporter bien (RMSEP = 0.395, 0.0195, 0.0087 pour le Sc, TA et pH respectivement), menant aux modèles de calibrage qui surpassent de manière significative ceux basés sur le plein-spectre analysent (RMSEP = 0.512, 0.0198, 0.0111 pour le Sc, TA et pH respectivement). En outre, une réduction significative du nombre de points spectraux exigés pour établir les modèles est réalisée et tous les nombres de longueurs d'onde pour établir les modèles de calibrage peuvent réduire de 84.4%. Ce travail a montré que GA pourrait trouver des valeurs optimales pour plusieurs variables disparates liées au modèle de calibrage et que le procédé de PLS pourrait être intégré dans la fonction objective conduisant l'optimisation. DEWEY : 664 ISSN : 0260-8774 RAMEAU : Algorithmes génétiques En ligne : http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T8J-4NS2G96-3&_user=1 [...] [article] Nondestructive measurement of internal quality in pear using genetic algorithms and FT-NIR spectroscopy [texte imprimé] / Ying, Yibin, Auteur ; Liu, Yande, Auteur . - 206-213 p. Génie Chimique Langues : Anglais (eng) in Journal of food engineering > Vol. 84 N°2 (Janvier 2008) . - 206-213 p. Mots-clés : Genetic  algorithms  FT-NIR  spectroscopy  Nondestructive  measurement  Internal  quality  Wavelength  selection  Partial  least  squares  Algorithmes  génétiques  Spectroscopie  de  FT-NIR  Mesure  non  destructive  Qualité  interne  Choix  de  longueur  d'onde  Carrés  partiel Index. décimale : 664 Résumé : An improved genetic algorithms (GAs) is used to implement an automated wavelength selection procedure for use in building multivariate calibration models based on partial least squares regression. The methods also allow the number of latent variables used in constructing the calibration models to be optimized along with the selection of the wavelengths. Studies are performed to characterize the signal and noise characteristics of the spectral data, and optimal configurations for the GAs are found for each data set through experimental design techniques. The experiments tested in this method were sugar content (SC), titratable acidity (TA) and valid acidity (pH). Despite the complexity of the spectral data, the GAs procedure were found to perform well (RMSEP = 0.395, 0.0195, 0.0087 for SC, TA and pH respectively), leading to calibration models that significantly outperform those based on full-spectrum analyses (RMSEP = 0.512, 0.0198, 0.0111 for SC, TA and pH respectively). In addition, a significant reduction in the number of spectral points required to build the models is realized and all of the numbers of wavelengths for building the calibration models can reduce by 84.4%. This work proved that the GA could find optimal values for several disparate variables associated with the calibration model and that the PLS procedure could be integrated into the objective function driving the optimization. Des algorithmes génétiques améliorés (gaz) est employés pour mettre en application une procédure de sélection automatisée de longueur d'onde pour l'usage en établissant les modèles multivariables de calibrage basés sur la régression des moindres carrés partielle. Les méthodes permettent également le nombre de variables latentes utilisées en construisant les modèles de calibrage à optimiser avec le choix des longueurs d'onde. Des études sont réalisées pour caractériser les caractéristiques de signal et de bruit des données spectrales, et des configurations optimales pour le gaz sont trouvées pour chaque ensemble de données par des techniques de plan d'expérience. Les expériences ont examiné dans cette méthode étaient le contenu de sucre (Sc), l'acidité titrable (TA) et l'acidité valide (pH). En dépit de la complexité des données spectrales, le procédé de gaz se sont avérés pour se comporter bien (RMSEP = 0.395, 0.0195, 0.0087 pour le Sc, TA et pH respectivement), menant aux modèles de calibrage qui surpassent de manière significative ceux basés sur le plein-spectre analysent (RMSEP = 0.512, 0.0198, 0.0111 pour le Sc, TA et pH respectivement). En outre, une réduction significative du nombre de points spectraux exigés pour établir les modèles est réalisée et tous les nombres de longueurs d'onde pour établir les modèles de calibrage peuvent réduire de 84.4%. Ce travail a montré que GA pourrait trouver des valeurs optimales pour plusieurs variables disparates liées au modèle de calibrage et que le procédé de PLS pourrait être intégré dans la fonction objective conduisant l'optimisation. DEWEY : 664 ISSN : 0260-8774 RAMEAU : Algorithmes génétiques En ligne : http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T8J-4NS2G96-3&_user=1 [...]